由于磁粉制動器內部有水循環系統用焊接或熱壓封閉水道，因為加工精度和焊接質量造成漏水問題屢屢發生，從而造成磁粉粘結，線圈燒壞不能使用，水冷式磁粉制動器工作時能輸出較大的制動力矩和滑差功率，因此被廣泛采用。

　　另外，還需要配備一套自動水循環系統，以保證磁粉制動器工作時產生的熱量與水交換帶出散發掉。操作上還需要時刻注意，開機時應先開水泵冷卻電機，以保證磁粉制動器正常運轉，提高運轉壽命。

　　顯然，沒有水循環的磁粉制動器，在操作和使用上比較方便的，由于磁粉制動器工作時，磁粉在磁場作用下，磁粉鏈不斷形成，又不斷被拉斷，以及磁粉和轉子之間、和定子之間的磨擦產生的熱量，僅靠外殼散發這些熱量顯然能力不足。

　　有的磁粉制動器生產廠家，設計制造出帶散熱片的磁粉制動器，提高散熱效率保證磁粉制動器的正產運行。